주민 대부분이 인근의 ‘블랙 박스 국제 산업 주식회사’에 근무하는 소도시 ‘블랙 폴스’.
블랙 박스 사의 주요 상품인 ‘블랙 박스’는 모든 것을 할 수 있는 최첨단 도구로 미국 전역에서 선풍적인 인기를 끌고 있다. 하지만 11살 소년 토 톰슨에게 있어서 블랙 박스란 부모님의 일자리를 보장해주는 상품일 뿐 별다른 즐거움을 주지 못한다. 그가 정말 원하는 것은 친구들이다. 그러던 어느날, 토는 하늘에서 떨어진 조그만 돌에 머리를 맞는다. 무지개 색을 가진 이 조그만 돌이, 원하는 것은 무엇이든 이룰 수 있게 해주는 신비의 돌 임이 밝혀지면서, 토와 새로 사귄 친구들은 이에 열광한다. 하지만 무지개 돌의 존재를 어른들이 알게 되면서, 이 돌을 나쁜 목적으로 사용하려는 어른들로부터 자신의 마을을 지키기 위한, 토와 새 친구들의 본격적인 모험이 시작되는데…