1980년대 미국 서부의 한마을에 우연히 들른 셰인은 한 선량한 농민의 집에서 신세를 지게 된다. 그 착한 농민은 셰인에게 쉬어가도록 배려해 준다. 하지만 죠는 라이커의 횡포에 시달림을 받고 있었다. 라이커는 마을 사람들을 몰아낼 계획을 세우고 있었던 것이다. 셰인은 이런 사실을 알게 된다. 마을의 축제가 있던 날, 라이커는 살인청부업자인 윌슨을 고용하여 마을의 주민을 살해한다. 이에 농민들은 마을을 떠나려 한다. 하지만 죠는 마을을 버릴 수 없다고 생각하고 그에 맞서 싸울 결심을 세운다.